ε- Полилизинът е светложълт прах със силна хигроскопичност и леко горчив вкус. Това е правоверижен полимер на лизин. Не се влияе от pH стойността, термично е стабилен (120 градуса, 20 минути) и може да инхибира устойчивите на топлина бактерии, така че може да бъде термично обработен след добавяне. Въпреки това, при среща с киселинни полизахариди, хидрохлоридни соли, фосфати, медни йони и др., тяхната активност може да бъде намалена поради свързване. Когато се комбинира със солна киселина, лимонена киселина, ябълчена киселина, глицин и висши мастни глицериди, има синергичен ефект. Молекулно тегло между 3600-4300 ε- Полилизинът има най-добра антибактериална активност и когато молекулното му тегло е под 1300, ε- Полилизинът губи своята антибактериална активност. Поради факта, че полилизинът е смес, той няма фиксирана точка на топене и започва да се размеква и разлага над 250 градуса. ε Полилизинът е разтворим във вода и слабо разтворим в етанол. Анализът на инфрачервения спектър на неговата характеристика показва, че има силни пикове на абсорбция при 1680-1640cm-1 и 1580-1520cm-1.